No contexto dos aeroportos entra também a dificuldade das empresas aéreas para continuar operando. Em Chapecó por exemplo, a Gol retirou voos entre aquele município e Florianópolis. Por ora, garantiu o secretário de Infraestrutura, João Carlos Ecker, não há risco de a TAM, que opera em Jaguaruna e Azul, que opera em Forquilhinha, retirarem os voos do Sul.